Les Agences sont des établissements publics à caractère social régis par la loi n°94-009 du 28 juillet 1994 portant organisation et fonctionnement des offices à caractère social, culturel et scientifique.
Les agences permettent au Ministère de la Santé d’accomplir sa mission et sont placés sous l’autorité directe du Ministre de la Santé.
On distingue :
- Agence Nationale des Soins de Santé Primaire (ANSSP)
- Agence Nationale pour la Transfusion Sanguine (ANTS)
- Société Béninoise pour l'Approvisionnement en Produit de Santé (SoBAPS)
- L'Agence Béninoise de Régulation Pharmaceutique (ABRP)
- L'Agence des Infrastructures Sanitaires des équipements et de la Maintenance (AISEM)
- Agence Nationale de Contrôle de Qualité des Produits de Sante et de l'Eau (ANCQ)